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Seltsam. Ich habe mein E460 jetzt schon etliche Male mit angeschlossenem USB-Stick heruntergefahren, ohne dass es einen Neustart gab 
Nachtrag: Ich habe das jetzt nochmal mit einem USB-Stick und einer per USB-Adapter angeschlossenen SSD getestet: Kein Neustart. Vorher habe ich das E460 sogar nochmal in den Ruhezustand geschickt, auch da alles bestens. Hast du vielleicht noch einen anderen Shutdown-Fix in der DSDT, @iPhoneTruth?
Ich hänge mal meinen Cloverordner an. Vielleicht findest Du oder wer andere darin einen Fehler!
Zum Verwenden von VoodooHDA:
Ich habe wohl in die DSDT alles eingebaut, was die AppleALC.kext zum Laufen bringen sollte.
Also Tonausgabe funktioniert mit AppleALC, aber das interne Mikrophon nicht. Da kann ich mich dann schlecht mit Siri unterhalten, und auch mit allen anderen nicht, geschweige denn etwas aufnehmen.So hat das keinen Sinn.
Darum VoodooHDA!
Mit der layout-id funktioniert das bei mir einwandfrei:
Wegen der USB-Geschichte: Wird bei deinem E560 der Treiber für den Embedded Controller geladen? Das müsste dannn ungefähr so aussehen:
Mein E460 fährt mit angeschlossenem USB-Stick, iPad und verbundener Magic Mouse problemlos herunterfahren, das iPad lädt auch am USB-Port auf.
Hast Du auch die Conexant CX20754/4 Audiokarte verbaut? Die ID ist bei mir auch die 3. Aber eben ohne internes (und externes) Mikro 
Bei mir sieht das mit dem AppleBusPowerControllerUSB so aus:
Mit angeschlossenen USB-Geräten fährt meiner komplett herunter, wenn ich den Laptop per Befehl oder Tastenkombination zunächst in den Ruhezustand versetze, danach aufwecke, wobei dann Bluetooth angibt, daß es nicht (mehr) verfügbar ist, und dann herunterfahre. Eine etwas aufwändige Methode.
Ja, schaut so aus. Der Eintrag unter "HDEF" ist noch aus deiner DSDT.
Werden die interne USB-Geräte (Bluetooth, Webcam) bei dir im IOReg-Explorer auch entsprechend angezeigt?
Wegen das Embedded Controlers: Das MacBookPro13,1 hat im keinen Eintrag unter "IOKitPersonalities", ich nutze daher die des MacBookPro12,1 mit Hilfe der SSDT im Anhang.
Ja, werden angezeigt, siehe Anhang:
Ich werde mal meine DSDT neu auslesen und patchen. Kannst Du mir mal all die Patches angegeben, die Du angewendet hast?
Das sind auch die meinen.
Allerdings hatte ich auch Fix _WAK Arg0 v2 verwendet. Warum hast Du den durchgestrichen? Sollte man den Patch besser nicht verwenden?
Ich kann hierzu nur sagen, das ich bisher keine „Operation Region“-Einträge mit dem Wert 0 gesehen habe, somit glaube ich auch nicht, das eine Änderung des Wertes etwas bringt... außer eine Fehlermeldung beim kompilieren.
Mensch, bin ich blöd 
Ich hatte den Patch in Kernel and Kext Patches / KextsToPatch statt unter Acpi / DSDT / Patches eingetragen! Da kann es natürlich nicht funktionieren. Habe einfach nicht richtig gelesen!
Nun ist der Eintrag an der richtigen Stelle und … Ausschalten / Shutdown funktioniert, wie es soll!
@Harper Lewis noch einmal besten Dank!
Und ein gutes Neues Jahr !!!
Hallo @Harper Lewis
Nachdem dieses Problem so gut gelöst werden konnte, habe ich mich an mein "altes" Problem wieder gewagt: WLAN und BT nach dem Ruhezustand. Die sind bei mir immer definitiv einfach weg. Da hilft dann nur ein Neustart. Und das kann ärgerlich sein, wenn man mitten im Arbeiten ist. Nun probiere ich schon tagelang, komme aber nicht weiter.
Könntest Du mir zum Vergleich mal Deinen kompletten CLOVER-Ordner hier hochladen, damit ich mal schauen kann, was da bei mir vielleicht fehlt? Besten Dank und Gruß!
Besten Dank für den EFI-Ordner.
Ich hatte das auch einmal, daß nach einem Cloverupdate WLAN weg war. bei einer späteren Version gings dann wieder.
