emuvariableUEFI-64.efi ist die von Moorviper genannte efi Datei. Diese ist ist dazu gedacht bei nicht vorhandem NVRAM diesen zu emulieren.
Nur mit dieser ist es dann möglich auf einigen Systemen den NVidia Treiber zu nutzen (soweit meine Informationen dazu).
diese kannst du jedoch auch deaktivieren, wenn du den clover installer ausführst und vor der installation den eintrag CsmVideoDxe-64 anstelle des EmuVariableUefi-64 wählst.
Damit sollte ein Combo Update keine schwierigkeiten bereiten.
Edit: sollte sogar in der config.plist möglich sein wenn man statt dem eintrag bei DisableDrivers im childitem den eintrag CsmVideoDxe mit EmuVariableUefi austauscht, sind beide installiert wird der jeweils eingetragene deaktiviert.