Was für ein Format ist denn auf diesen Platten? Mojave hat manchmal die Unart, bei jedem Start alle Nicht-APFS-Platten durchzuchecken. Aber das ist dann ja erst der zweite Teil.
Dass Asus für den BIOS- und dann Clover-Start ewig und drei Tage braucht, kenne ich leider von meinem X99er auch. Nur der Oldie EX58 mit altem BIOS braucht ähnlich lange. Aber wenigstens das nachgelagerte "File-Check" versuche ich zu meiden. Über SSD bootet der übrigens so manches Mal geradezu erschreckend schnell. Das kann auch die direkte Kopie der Nvme sein, die haben einfach eine Reihe weniger Kontrollen.