Genau hier liegt das Problem. Der 16_2 Slot geht nicht, wenn eine Karte im 16_1 Slot steckt, die alle 16 Lanes des Slots braucht (also z. B. eben die Vega 64). Und der 16_3 Slot geht nicht, wenn einer von den unteren SATA-Slots SATA6G_5 oder SATA6G_6 belegt sind.
Schau mal in dein Handbuch oder siehe zur Erklärung mein Bild. Du musst einen der eingekreisten Slots verwenden.
EDIT: Wenn die Karte für die schmalen Slots zu breit ist, musst du PCIE16_3 nehmen, aber dafür sorgen, dass nichts in den angegebenen SATA-Slots steckt.
Und wie gesagt, gern korrigieren, falls ich damit falsch liege
Edit by DSM2: Vorschaubild reicht aus!