Du hast also 2 SSDs und noch zwei weitere Festplatten angeschlossen? Hast du mal probiert alles bis auf eine SSD (z.b. für MacOs) abzuklemmen?
Wie hast du das System denn am Anfang installiert? Wenn es jetzt nicht auch genau so wieder funktioniert hast du entweder A) keine Ahnung mehr wie (mit welchen Einstellungen) du es damals zum laufen bekommen hast oder B) etwas ist kaputt. Im Fall A hilft dir wohl nur rumprobieren und im Fall B wohl nur Ersatzhardware, wobei da dann ein anderes/neues MB am sinnvollsten wäre? Die Installation hat ja schon mal funktioniert, ich hab Zweifel dass da irgendein Firwmwareupdate irgendwas behebt.
Vielleicht kannst du die SSDs auch mal an einem anderen Rechner dranhängen um zu schauen ob die noch funktionieren. Vielleicht kannst du dann auch irgendwelche Diagnosetools laufen lassen um die SSDs zu checken oder zu reparieren.