Ich konnte neulich einen Fehler im APFS-Datenvolume (in meinem Fall /dev/disk4s1) korrigieren, in dem ich Im Recovery-Modus in der Console fsck auf den zugehörigen APFS-Container /dev/disk4 ansetzte:
vorher Überblick über Partitionsnamen verschaffen mit:
Eventuell muss vorher im Recovery-Mode z.B. mit Festplattentool der Container und das Volume unmounted werden (heisst "Deaktivieren" im Menü).
In meinen Augen sind APFS-Fehlerkorrekturen ein dunkles Kapitel, mit third-party Tools sollte man äußerst vorsichtig sein.