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Eigentlich steht das eine (Whitelist) in keinem Zusammenhang zum anderen (Trackpad) sprich diese beiden Bereiche haben keinerlei Berührungspunkte zueinander. Wäre es Dir vielleicht möglich mal ein anderes Linux zu testen um auszuschließen bzw. einzugrenzen ob es sich dabei um ein Hardware Problem oder um ein Software Problem handelt? Hardware scheint mir allerdings unwahrscheinlich weil Du ja schreibst das das Problem immer erst nach einiger Zeit Betrieb auftritt und nicht von vornherein...

Hum oder ob da vielleicht des Thinkpad's most famous "Nuppel also known as Trackpoint" spinnt? Wäre nicht der erste bei dem das Teil nen Schaden hat und sich selbst und ständig macht. Die Tastatur von Deinem ist ja generell nicht mehr so pralle von daher würde ich das zumindest im Bereich des möglichen sehen...