Ich bin gerade super verwirrt... Du hast mir doch schonmal einen El Cap IOReg geschickt:
Im Anhang eine Zip von der IO Registry.
War damals ein USB Fix eingestellt? Ich würde gerne mal die IORegs des nicht funktionierenden El Capitan Systems, mit einem IOReg eines funktionierenden Systems (also entweder UEB Fix + ElCap oder Yosemite) vergleichen...